Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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