Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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