Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms