Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Aqp4P55088 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms