Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PctpP53808 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PctpP53808 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PctpP53808 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms