Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lbx1P52955 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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