Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
GdnfP48540 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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