Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
VhlP40338 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms