Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprkP35822 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprkP35822 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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