Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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VtnP29788 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
VtnP29788 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VtnP29788 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VtnP29788 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VtnP29788 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VtnP29788 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VtnP29788 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VtnP29788 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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