Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RxraP28700 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RxraP28700 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RxraP28700 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RxraP28700 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxraP28700 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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