Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BgnP28653 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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