Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa5P28312 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa5P28312 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms