Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gjb1P28230 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms