Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms