Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChgaP26339 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms