Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms