Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RhoP15409 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RhoP15409 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RhoP15409 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RhoP15409 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RhoP15409 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RhoP15409 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RhoP15409 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RhoP15409 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RhoP15409 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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