Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01641 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P01641 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P01641 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P01641 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P01641 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P01641 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P01641 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P01641 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01641 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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P01641 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms