Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cd200O54901 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cd200O54901 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cd200O54901 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cd200O54901 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cd200O54901 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cd200O54901 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cd200O54901 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cd200O54901 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Cd200O54901 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cd200O54901 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cd200O54901 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms