Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk2a2O54833 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms