Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DffaO54786 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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DffaO54786 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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DffaO54786 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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DffaO54786 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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DffaO54786 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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DffaO54786 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DffaO54786 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DffaO54786 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DffaO54786 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DffaO54786 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DffaO54786 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DffaO54786 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DffaO54786 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DffaO54786 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DffaO54786 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DffaO54786 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DffaO54786 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DffaO54786 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DffaO54786 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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DffaO54786 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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