Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
EdaO54693 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
EdaO54693 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
EdaO54693 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms