Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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Opn1mwO35599 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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Opn1mwO35599 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Opn1mwO35599 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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