Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Kcns1O35173 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms