Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17078M0QW51 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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