Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Them7-201ENSMUST00000068813 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gpn1-201ENSMUST00000076949 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Klrb1c-203ENSMUST00000174404 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm4287-201ENSMUST00000174329 585 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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