Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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