Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms