Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms