Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vmn1r58G3X9U3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms