Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms