Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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