Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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