Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atf6F6VAN0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms