Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms