Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms