Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6685D3YYP3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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