Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Phf11bB4XVQ1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms