Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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