Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms