Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm6880A3KG45 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6880A3KG45 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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