Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PplQ9R269 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms