Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf346Q9R0B7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms