Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gpc6Q9R087 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Gpc6Q9R087 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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