Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nubp2Q9R061 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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