Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Fhl3Q9R059 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms