Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms