Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms