Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Ccdc97Q9DBT3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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